Jaguares de Córdoba es uno de esos clubes que surgió tras la compra de la ficha profesional de otros equipos, en este caso apareció en 2012 en reemplazo del Sucre F.C., que a su vez fue antes el Pacífico F.C., Deportes Palmira y  previamente Girardot F.C.

El equipo, ahora de Montería, adopta sus colores directamente de la bandera de Córdoba, departamento al cual representa y del que recibe patrocinios (Gobierno local y empresas públicas departamentales.

El celeste es el color principal, siempre usando vivos en verde y blanco. Si bien aún no existe una identidad gráfica más allá de la tonal, se destaca la presencia del Jaguar sublimado en el pecho de las camisetas, mismo que aparece a full color en el escudo.